Vyšetřování prováděla Společná vyšetřovací skupina pod vedením generálního prokurátora Nizozemska, Rusko se nezúčastnilo.
Vyšetřovatelé tvrdí, že Boeing byl sestřelen z protiletadlového raketového systému Buk, který patřil k 53. protiletadlové raketové brigádě z Kursku. Dodán měl být údajně z Ruska, poté byl vrácen zpět.
Jak dále uvedl náměstek ruského generálního prokurátora Nikolaj Vinničenko, daná skupina ignorovala údaje z Moskvy z ruských radarů a dokumentaci o tom, že raketa, která zasáhla Boeing, patřila Ukrajině a byla vypuštěna z území kontrolovaného Kyjevem. V první den soudního řízení však strana uznala, že obdržela a zkoumá údaje ruské prokuratury.
Rusko kategoricky odmítá všechna obvinění z účasti na havárii a opakovaně prohlásilo, že vyšetřování je neobjektivní.
Jak poznamenal Vladimir Putin, Moskva nebude moci uznat výsledky vyšetřování, kterého se plně neúčastní.
Soud začal v Nizozemsku tento rok 9. března. Soudní řízení se týká čtyř osob – Igora Girkina, Sergeje Dubinského, Olega Pulatova a Ukrajince Leonida Charčenka. Pulatova před soudem zastupuje mezinárodní skupina složená ze dvou nizozemských a jednoho ruského právníka. Ostatní jsou souzeni v nepřítomnosti.